ההשתתפות בתכנית היא אך ורק דרך מועמדות.
העמיתים המשתתפים נבחרים לראשונה על ידי ועדת מועמדות גלובלית )Global Nominating Committee(, המורכבת ממומחים בתחומם )כגון אוצרי מוזיאון, מגישי פסטיבלים, ראשי מחלקות באוניברסיטה( מחמש יבשות שונות. הפאנל מינה אמנים יוצאי דופן משלל דיסציפלינות שונות, שהכישורים והאישיות שלהם יביאו אנרגיה יצירתית חדשה, השראה, תחושת שיתוף פעולה ויצירת פוטנציאל.
המועמדים הוזמנו לסקור קבוצה שנבחרה מראש של ארגוני תרבות ירושלמיים שיושבים במזרח ומערב ירושלים )ראו דף ארגונים מארחים(, איתם הם ירצו לשתף פעולה. מידע מפורט על כל אחד מהארגונים המארחים זמין באתר של עמיתי ירושלים הבינלאומיים. אדם אחד מכל ארגון פנה למועמדים כדי לבחון רעיונות לפרויקט. הבקשות נבדקו על ידי פאנל של מומחים שבחרו בקבוצה קטנה של פיינליסטים. הארגונים המארחים בחרו את העמיתים על סמך הפרויקט שהוגש, וההתאמה הכוללת שלו לכל מוסד.
העמיתים הנבחרים יגיעו יחד ויישהו בירושלים כקבוצה.